编造歪理邪说是邪教的共同特征，门徒会也不例外，只是门徒会编造的歪理邪说大多扭曲基督教的教义。 

　　——门徒会宣扬“父神·基督·圣灵”三位一体。门徒会虽然也称神是三位一体的，但对于“三位一体”神观，他们根本不理解，并随意解释，如“父神有一个独生子——基督（季三保），基督与圣灵（许明潮）是夫妻，圣灵是父神的儿妇。基督成为肉身来拯救人类，圣灵也要成为肉身来拯救人类。” 

　　——门徒会否认“神人二性”的耶稣基督。门徒会把基督与耶稣分离，以为基督的本质是“基督的灵”，而不是神人二性的耶稣基督。他以为耶稣就是一个普通的人，在耶稣受洗时，“基督的灵”降在耶稣身上，从此，耶稣才成了基督。季三保宣扬“基督的灵”再次从天上下来降在他身上，而耶稣仍留在天上。他把基督再次成为肉身解释为：“圣父从耶稣身上取走了基督的灵，放在了三赎的身上”；“耶稣和三赎是基督的灵在两个身体里运行'。他们照如此推断："基督虽已二次道成肉身，但耶稣还在天上，直等到世界的末日他要再来"。 

　　——门徒会宣扬“三赎”基督救度世人。门徒会称“神”对世人的“救赎”有三次：第一次是挪亚方舟的救赎，第二次是耶稣基督的十字架救赎，第三次是门徒会教主季三保（又称“三赎主”）的救赎。门徒会否认耶稣基督救赎的功效，声称季三保弥补了耶稣的不足，“三赎”道成肉身和凡人一样，有家眷、地产等，受了我们每个人所受到的苦，他才配担当我们每个人的罪，他里面装着神的灵，上与神沟通，下与人沟通，有人的一面，有神的一面，成为了“中保”。在当今时代，基督就是三赎，除他之外，别无拯救。所以一切不信他的基督徒都将和非基督徒一样遭到审判，坠入硫磺火海。  

　　——门徒会宣扬祷告治病。门徒会宣称疾病是因犯“罪”而带来的报应，不准信徒就医服药，只要整天祷告就能好。如陕西省许家庄的窦宗里相信门徒会的祷告治病，结果在季三保家里，在门徒会会长季三保、执事陈世荣等人的亲自祷告中却死去。 

　　——门徒会宣扬“神”赐福粮。门徒会胡说“信教可以每人每天只吃二两粮，不用种庄稼”，使受骗群众不种地、不锄草、不施肥、不养畜。河北饶阳县段某参加门徒会后，到处宣传“往后干活没用了，只要信主信神就行了”，他把拖拉机和其他农机具卖掉，把蔬菜大棚拆了，使全家生活陷入窘境。 

　　——门徒会宣扬“世界末日”来临。门徒会大肆渲染圣经中关于末世的预言，制造世界末日恐慌气氛。他们说信徒在肉身活着的时候，世界末日就要到了。末日到来之时，神要毁灭这个万恶的世界，“地震、火灾、洪水、冰雹、瘟疫、蝗虫、风暴等将袭击人类，坏人要死光，好人死掉一半”，只有信“三赎”的人才会免去灾难。他们因此教导信徒不必努力耕种、生产，只要好好祷告等候末日来临。