此阶段从2003年初到2004年底。这一阶段的特点是，法轮功公开与台独、民运等敌对势力合流，竭力反华反共，彻底暴露其反动政治本质。
西方敌对势力出于其冷战惯性思维和分化、西化中国的长期战略图谋，必然要对法轮功加以长期的扶持和利用；境外的敌对势力出于其破坏我国家稳定、颠覆我国家政权的共同目的，必然要与法轮功相互借重和利用；法轮功出于其顽固的反动本质和卖身投靠的政治需要，必然要负隅顽抗，与我长期对抗。得到西方反华势力和台独分裂势力支持后，一方面李洪志及其法轮功组织财大气粗、有恃无恐；另一方面又为了表功、捞取主子们的更大奖赏，更加积极地从事反华反共活动，成为境外民运和反动势力中的“带头大哥”。
（一）明目张胆煽动推翻中国共产党
李洪志入过团、当过兵，复员后提了干，政府还给其安排了工作、分配了房子，甚至连其做阑尾炎手续的费用也拿到单位报销。按理说中国政府和中国共产党对其恩重于山。但由于境内法轮功人员大量转化，剩下的几个残渣余孽已经溃不成军。国内败局已定，李洪志一伙恼羞成怒、忘恩负义，逆历史潮流而动，完全拜倒在西方敌对势力和台独分裂势力的脚下，依靠反动势力所给予的资金、人员和技术帮助，积极充当其帮凶和走狗，更加疯狂地从事反共反华活动：
一是恶毒攻击政府，煽动仇视情绪。2003年春夏之季，中国一些地方出现“非典”灾情，号称“慈悲”的李洪志不仅对此幸灾乐祸，还按捺不住内心的喜悦，借此攻击中国政府。他在2003年4月《在大纽约地区法会的讲法和解法》中这样说道：“你们看到了当前中国出现的这场瘟疫了吧？这不是大瘟疫降临了吗？用人的话讲这就是天在治人。针对什么事的，我们的大法弟子都清楚——是针对那些大法弟子在讲清真相中不配救度的，救度不了的人，而对邪恶烂鬼又没什么用的那一部分，这是第一次清除。天在治恶，……这还不是真正的法正人间时开始的大清除哪，那个大清除来的时候更可怕，那是针对全世界来的。恶人要张狂起来的时候啊，天不怕地不怕的，可是灾难真正来到头上的时候他就傻了。”
在《2003年加拿大温哥华讲法》中，李洪志借“非典”疫情对中国政府进行恶毒污蔑和诋毁，把“非典”说成是由于政府迫害“大法弟子”造成的，是神在“警示”人，并造谣说：“他们不但不知反省，还在利用萨斯迫害大法弟子，掩盖真相”。他恶毒地诅咒中国政府，煽动弟子仇视政府的情绪：“执政者也是人，也在天惩之中”。“神在警示世人，人还想掩盖，不叫世人接受教训，那就等着更大的天治吧。”
李洪志在《在大纽约地区法会的讲法和解法》中还得意洋洋地预言：“看着吧，今年是一个很热闹的年哪，有很多事情要发生的”，他断言“非典”已经传入了中南海，中央政治局常委都倒下几个，并且预言“马上上海的萨斯病就全面起来了。”
《在2003年美中法会上的讲法》中，李洪志说：“是你××党自己在迫害人民群众中把自己迫害倒了，迫害中助长着假、恶、斗、腐败，失去了民心。很多人在知道了真象之后都在思考：这个政府连这样邪恶的事情都能干得出来，什么谎言都能造得出来，这政府不可怕吗？”
由此可见，李洪志公然煽动法轮功练习者对中国政府和中国共产党的仇恨和敌视。
二是公然煽动推翻中国共产党的领导和社会主义制度。李洪志在2003年6月22日《在2003年美中法会上的讲法》上，再一次明目张胆地叫嚣要推翻中国共产党，煽动法轮功人员走上反党反政府的道路。
三是以“成仙成佛”为诱惑，鼓动法轮功练习者“走出来”与中国政府对抗。
利用“圆满”、“成仙成佛”诱骗痴迷者从事反人类、反社会活动是李洪志的一贯伎俩。2004年李洪志故技重施：2月28日，他在《2004年洛杉矶讲法》中说：“大法弟子无论遭受什么样的痛苦最后都会走向神。”4月12日，《在亚太地区学员会议上的讲法》中李洪志说：“我今天看到的你们都是非常理智的、非常冷静的，而且做得稳重。其实你们再也不是常人中的人了，你们都回不去了，你们真的回不去了，你们和常人的差距相当之大了。”在7月24日的《2004年华盛顿DC法会上的讲法》中，李洪志再次煞有介事地说，修炼“将要进入尾声”，“即将就要结束了”，“邪恶的生命已经少之又少，它们只是在躲藏了”，“到目前为止只剩过去的百分之五左右”，“时间真不多了，特别是没做好的，应该抓紧时间做好”。
李洪志还在他发表的歪诗烂词《天门已开》、《大法徒》中也用“成神”、“成仙”，诱惑、逼迫练习者赶快“走出来”闹事。
四是诅咒中国政府是“邪恶政权”，赞扬美国，鼓动法轮功练习者“扔掉身体”与中国政府对抗。
为了适应反华势力的需要，重振旗鼓，掀起新的闹事高潮，李洪志《在2003年亚特兰大法会上的讲法》中，咒骂中国政府是“邪恶的政权”，并把我国与所谓的“民主”国家对立起来，吹捧美国的霸权主义做法，说美国是“旧势力”安排的国际警察，是维护正义的。
他说：“美国的立国之本就是信仰自由，讲人权。……对大法弟子的迫害都直接触动了美国最根本的利益，触动了它的立国之本。那为什么美国政府不管哪？我是从体谅他们的角度讲了，旧势力在中东地区搞乱，然后叫美国腾不出手来，没有精力集中到中国那儿，管不了大法弟子被迫害的事。”“因为美国在世界上扮演的角色就是秩序的维护者，实际它就是国际警察。……如果美国政府真的不负这个责任、不起这个作用，神就不会叫它这么强大，神也不会让它富裕。不是美国人就应该特殊，是因为神安排了它。”
在2004年5月23日美国芝加哥法会上，李洪志围绕讲清真相等问题，大肆煽动境内法轮功痴迷者出来闹事。李洪志借口“执著心”像“像花岗岩一样的顽石，一旦形成人根本动不了它了”“所以到了一定的时候、能圆满的时候，这个身体赶快扔掉，一秒钟都不能等”，暗示弟子们不要在乎自己的生命，关键的时候到了，要不惜一切和中国政府以死相拼。
（二）公开与敌对势力合流
法轮功邪教组织不仅公开投靠西方反华势力和“台独”分裂势力，而且还与境外“民运”、“东突”、“藏独”势力串通一气，互相策应，在各种国际场合制造事端，向我发难，为西方国家干涉我国内政制造借口，严重威胁中国国家安全和社会稳定。
台独分裂势力与各种敌对势力的相互勾结、整合。随着中国大陆综合国力不断增强，国际地位与影响不断提升，两岸实力对比中“我强台弱”的趋势愈发明显，中国大陆政府遏制“台独”的新措施不断，陈水扁及执政的民进党当局“台独”企图不断遭受挫败。他们不甘心失败，除了通过各种方式鼓吹法理“台独”、推行文化“去中国化”路线，甚至叫嚣要“全民公投”、“台湾正名”、“以台湾名义加入联合国”外，还加强了对境内外敌对势力的资助和扶持。与包括法轮功、“民运”、“藏独”、民族分裂分子等在内的各种“毒瘤”沆瀣一气，相互串通，妄图“数毒合流”，组成所谓“反共联合阵线”。
王丹、魏京生、费良勇等民运头面人物获得台独分裂势力的资金支持后，一方面大肆出卖自己的良知和灵魂，公开做台独分裂势力的走狗和帮凶，疯狂从事破坏祖国统一和安全的活动，甚至叫嚣“山东也可以独立”（魏京生语）。另一方面他们按照美国和台湾主子们的旨意，公开为法轮功摇旗呐喊。一个个言不由衷，丑态百出。
对于“法轮功”邪教，台当局不但认为它是“合法组织”，诬蔑祖国大陆取缔“法轮功”邪教的正义之举是“打击自由人权”、“宗教迫害”。还将法轮功作为敌对势力的“领头羊”来培养，千方百计整合境外敌对势力，大力支持法轮功的反动活动。吕秀莲等死硬“台独”分子赤裸裸地说，支持法轮功就是要让中国领导人“日子不好过”，“使中共把主要精力花在处理法轮功问题上”。
台湾当局借助“台湾民主基金会”向法轮功组织提供巨额资金，支持法轮功组织建立宣传机构。台湾行政院任命台湾法轮功负责人张清溪为中央广播电台常务董事，以表明当局对法轮功的支持。法轮功得到台湾当局的大量资金资助。法轮功攻击我卫星的基地在台湾，“希望之声广播电台”设在台湾台中地区。中国境内查获的法轮功电视插播设备也都是台湾生产的。2004年台湾选举，台湾法轮功组织全力支持台独分子陈水扁，极力与“民进党”勾结，为其大选呐喊助威。李洪志在2004年的《在亚太地区学员会议上的讲法》中明确要求法轮功练习者以个人名义参加台湾“选举”和“公投”，支持分裂国家的党派和方案。2005年3月26日，法轮功组织又积极参与了台湾分裂势力组织的反对中国政府《反国家分裂法》的大游行，号称十二路队伍有三路是法轮功组织的。
据海外民运组织“民主正义党”披露：（http://127.0.0.1:8567/dmirror/http/cdjp.org/Articles/article.php/608）：“是替法轮功当门面的大陆民运人士，阿扁政府也另外资助他们，不替法轮功当门面的大陆民运人士，从阿扁政府那里基本上是没有希望（得到资助）的”、“阿扁政府是真心要支持法轮功，对资助中国大陆民运并不感兴趣。大陆民运人士要得到资助，必须去参与法轮功，最起码也要偶尔捧捧场。”
台湾当局除借助“台湾民主基金会”向法轮功组织提供巨额资金，同时从人力、物力方面大力支持法轮功组织建立宣传机构。法轮功媒体“大纪元”所载《新唐人与欧卫解约风波的来龙去脉（二）》（http//www.epochtimes.com/gb/5/5/2907350p.htm）中披露：“刚刚创台时，因为维持节目制作和播出的人员都奇缺……后来，一些台湾学生义工和在台湾大电视台的专业人员知道纽约的艰难后，或者在暑假期间、或者在休年假期间跑到纽约来支援，形势才缓解一些。”由此可见，没有台湾分裂势力对法轮功 “无微不至” 的关照，法轮功这个“巫毒娃娃”不可能生存到今天。
法轮功和“民运”等“毒瘤”得到台独分裂势力指使后，轻者制造大陆谣言，抹黑社会主义制度，欺骗不明真相的人民群众，重者千方百计制造社会动荡，妄图颠覆祖国大陆政权，分裂中国。
法轮功还与香港“民主派”沆瀣一气，成立“反对23条大联盟”，在反华浊流中充当马前卒，极力巩固香港法轮功组织桥头堡地位。李洪志要求，香港法轮功组织要充分发挥濒临大陆的桥头堡作用，要借反对23条立法之机，加强闹事活动。为此，香港法轮功组织头目简鸿章与民主派骨干司徒华、香港基督教主教陈日君、神父罗沃启等人公开参会，并与法轮功共同发表反对23条立法言论。2003年，在敌对势力策划的反对“香港基本法23条立法”的“七一”游行事件中，法轮功邪教组织积极参与，与其他敌对势力沆瀣一气，推波助澜，并积极支持香港民主派参加随后的地区选举。
香港“大纪元时报”负责人也与明慧网、新唐人电视台等法轮功传媒机构负责人进行了讨论，决定改变过去只向公众发传单、哭诉受害、博取同情的做法，加强与民运等各方势力的全面合作，围绕反对“香港基本法23条“立法开展一系列活动，并将活动推向社会，把法轮功邪教组织包装成一支关心香港本地事务、为民众争取权利的力量，争取更多支持和帮助。香港法轮功准备通过各种途径让国内有文化、有技术、年轻的法轮功人员出境，申请政治避难，到联合国起诉作证，制造影响。法轮功媒体连续刊载多篇“民运”分子及台独人物，如曹长青、明居正等人的署名文章，为法轮功闹事宣传造势。
此外，法轮功还与其他反华势力的勾结。2004年初，由大纪元集团发起，勾结近40个境外敌对组织和个人，成立了“保卫言论自由人权同盟”，声称要“支持中国大陆的言论、新闻、出版自由，揭露和抵制中共对公民言论自由等基本权利的侵犯”，企图进一步打人权牌，同中国政府对抗。
2004年初，法轮功策划“全球营救受迫害学员委员会”，联合“中国工党”、“民联阵”、“中国自由民主党”等38个民运组织向联合国第60届人权会议递交际了“谴责中国人权决议”，并纠集大批法轮功分子在人权会议会场外闹事。2004年7月，法轮功总部指示“法轮功之友”联合“国际司法正义协会”、“中国支持网络”、“中国自由教会”等17个组织，借在瑞典举办国际非政府组织论坛之机，召开“新时期的群体灭绝”研讨会，通过所谓的决议。
法轮功邪教组织已经成为西方敌对势力和境外反动势力颠覆、干扰、分裂中国的重要政治工具，一支政治上的别动队，李洪志及境外法轮功邪教组织公开叫嚣“形不成对抗就没有力量”，不反、不闹在美国、台湾主子们面前就不好交帐，就得不到支持，难于生存和发展。因此，法轮功组织积极为反华势力、台独等势力总体战略服务。
（三）疯狂制造谣言，反对中国政府
在反华势力和台独分裂势力的支持、指使下，法轮功已经形成了以“大纪元时报”、“明慧网”、“希望之声广播电台”、“新唐人电视”、“博大出版社”、“神州电影制片厂”等为核心的完备的立体反动宣传体系，还成立了“神龙工作队”提供技术支持，疯狂制造反对中国共产党和中国政府的反动舆论。目前，法轮功已经形成了100多个专业性网站、300多个地方性网站的全球网络体系，利用这些网站进行宣传渗透和操控指挥境内外法轮功人员活动。目前境内外的反动消息和谣言80%以上来自“法轮功”；“大纪元时报”号称“全球最大的华人媒体”；“新唐人电视台”租用三颗国际卫星，24小时向世界各地播出；“希望之声广播电台”、“放光明电台”、“明慧电台”也24小时在境外播出，竭力想在中国境内落地。
2003年2月，为配合西方反华势力在2003年联合国人权会议上制造反华提案的图谋及美国的总体战略，李洪志专门抛出了“告倒政府即可翻案说”，强调只要“告倒了中共高官，就能向国际说明中国政府对法轮功的处理是错误的”，矛头直指中国政府领导人，要求“所有法轮功骨干都要向国内联络员找证据”。对此，“法轮大法信息中心”立即召开境外法轮功邪教组织的宣传机构负责人网络电话会议，传达李洪志指示，提出了以联系民运组织，捏造一些内幕再添油加醋搞造谣、滥诉活动，李洪志声称：“不管用什么手段，只要告倒就行。”目前，法轮功在境外针对我领导人、公务人员、亲华侨领发起滥诉六十多起，绝大多数以失败而告终，为了逃避法律责任。法轮功组织不断让一些法轮功人员“原告”宣布“破产”，以逃避经济惩罚，甚至不惜让一些成员蹲“洋监狱”来躲避经济处罚。
2003年4月，李洪志提出所谓“新三件”（搜集高官腐败证据、揭露中共建政以来的谎言、起诉中国领导人）。境外的法轮功组织与其他敌对势力相勾结，以滥诉为煽动点，在全球滥诉我政府官员几十起，加紧组织策划各种破坏捣乱活动，陆续成立“追查迫害法轮功国际组织”、“追查中国迫害法轮功罪行委员会”等一系列机构。在开展“调查”和“营救”行动的同时，法轮功邪教组织将重点由搜集“迫害”案例转向搜集“腐败”证据，指示境外法轮功骨干全力搜集所有我新一届领导人有无子女在境外，有无境外资产等“腐败把柄”，或编造谣言进行炒作，妄图借此“抹黑”、“搞臭”中国政府。法轮功还联合境外70多个敌对组织和20多个敌对分子，策划成立了“全球审x大联盟”，多次模拟组织公审，把滥诉活动推广到境外十多个国家和地区。利用外国法律和司法程序大肆进行诬告活动。法轮功牵头成立了“全球公审联盟”“调查受迫害情绪组织”等，不择手段地对我党和国家领导人、公务人员进行诬告。
每遇中国代表团特别是领导人出访，境外法轮功组织都要从世界各地调集人马，特别是从台湾抽调人手，在中国代表团驻地和主要活动地点进行所谓的讲真相、发正念活动。境外法轮功组织还千方百计地挤进多边国际会议，编造谣言，制造事端，寻衅滋事。
尽管李洪志剽窃原北京师范大学历史系博士研究生李卫东《人是太空人的试验品》中的“成果”，宣称：“它（外星人）发现了人体是非常完善的，完美的，所以它想要人体，它想要最后代替人。人将被成为计算机、机器的奴隶，最终被外星人代替。计算机为什么发展这么快？人的脑子突然间就那么活跃？都是外星人操纵人的思想搞出来的。每一个会操作计算机的人外星人都给你们编了号，真是这样”（《法轮佛法──在欧洲法会上讲法》），但这不妨碍李洪志将计算机和互联网技术视为自己的特异“功能”，竭力加以开发利用。
李洪志声称“突破网络封锁是一件重要的工作”、“如果谁能做成了，就是为大法立了大功。”要求所有境外法轮功网上技术骨干“利用美国网络、硬件条件，全力以赴突破网络封锁”。境外的法轮功经向美国政府申请资金，成立了秘密的“极景公司”等网络技术公司，研究对中国网络的探测、攻击工具。开发出“无界”等破网工具和网站，这些网站开发出来后，法轮功除了将自己的“明慧网”、“大纪元”、“新唐人”等媒体作为主要的宣传渠道外，还将一些民运网站列为宣传次重点。甚至将一些藏独、疆独门户网站列入链接。通过这些手段，法轮功不断通过网络，造谣生事，遥控世界各地法轮功分子闹事，其反华、反共之狼子野心昭然若揭。