雍正三年十二月，雍正历数年羹尧九十二条罪状，赐其狱中自裁；雍正五年十月，雍正帝历数隆科多四十一条罪状，将隆科多永久禁锢，隆科多于八个月之后死在了禁所。
至此，雍正帝的左膀右臂就这样折断了，说起来，年羹尧似乎并没有想到雍正帝会拿他开刀，但隆科多似乎早就想到了。因为这四十一条罪状中有一条是：
“妄拟诸葛亮，奏称‘白帝城受命之日，即是死期已至之时’”
从这里来看，隆科多对朝堂上的政治斗争看得很是明白，知道但凡顾命大臣，其结果都是被皇帝猜忌而惹来杀身之祸，这并非是危言耸听，古往今来，接受遗命的大臣确实很少有好结果的，因为这本身就是皇帝与重臣的斗争。
新任皇帝要亲政，要加强皇权，而顾命大臣要稳固自己的地位，彼此之间就会出现拉锯战，不是东风压倒西风，就是西风压倒东风，不是君强臣弱，就是君弱臣强，总要有一个结果。君弱臣强的案例不少，这样的通常是臣子去世之后遭到清算，比如霍光、张居正等，而君强臣弱，比如雍正帝。
雍正帝是不会允许有臣子威胁皇权的，更不会留着对自己不再忠心的臣子，但其实我们看年羹尧和隆科多的故事，尤其是年羹尧的故事，总给人一种先秦时期“郑伯克段于鄢”的感觉，所谓的“多行不义必自毙”本身就像是郑庄公的阴谋。
郑庄公不动声色地看着弟弟野心渐大要攻打郑国国都，而雍正帝刚继位那会，给了年羹尧和隆科多最大的信任，用他自己的话说就是“朕御极之初，隆科多、年羹尧皆寄以心腹，毫无猜防。”之所以这样信任也是因为“世宗之立，内得力于隆科多，外得力于年羹尧，确为实事。”
而隆科多原本是雍正帝的舅舅，说是舅舅也不算是亲舅舅，隆科多的姐姐是雍正帝的养母孝懿仁皇后但佟国维却是康熙帝的亲舅舅，佟国维的姐姐佟佳氏是康熙帝的生母孝康章皇后。
所以，佟国维在康熙帝时期是一个很强悍的存在，但隆科多并不是，更准确地说，隆科多的选择和佟国维的选择是不一样的，在九子夺嫡中，以佟国维为代表的佟家支持的是八阿哥胤禩，这让康熙帝很是失望，也因此，但幸亏时任步军统领的隆科多并没有站在八阿哥这一边。
《雍正王朝》中，佟国维是个老狐狸，他领着一家人站在八阿哥这一边，却并没有让隆科多站队，因为他觉得不能在一棵树上吊死。但在史籍中，并未说明隆科多为什么没有和家人一样站在八阿哥那一边，不过他或许是将康熙帝的敲打放在了心上。
康熙曾在朱批中敲打他：“你只须行为端正，勤谨为之。此任得到好名声难，得坏名声易。兄弟子侄及家人之言，断不可取。”聪明的隆科多似乎看懂了康熙帝的意思，并没有急着站队。
等到了康熙帝临终的时候 ，就将隆科多召到跟前，接受顾命。所以后面雍正帝能顺利继位，隆科多是发挥了很多的作用的。
等到雍正帝继位之后，将隆科多抬到了很高的一个位置，毕竟即是功臣又是舅舅，自然地位非比寻常，不仅官位一升再升，就是朝廷在铨选官员的时候，隆科多都可以不用奏请而直接挑选，这在当时更是被称为“佟选”，由此可见，雍正帝对隆科多的信任。
也因此，虽然隆科多在雍正帝初即位的时候就知道像他这样的顾命大臣没有好结果，很可能会被雍正猜忌杀死，但能看到这一点的何止有隆科多这一个顾命大臣，看到是看到，能改变命运的却并不多，尤其是愿意急流勇退的就更少，总有人觉得自己是那个例外，可以侥幸善终，隆科多也是如此。
他虽然早就想到了自己很可能会被雍正帝猜忌而死，但因为雍正帝的信任和委以重任，又给了他一种错觉，让他觉得他可以做那个善终的人，可以在和雍正帝的博弈中不输。
但雍正帝是什么人？他可是清朝历史上相当有魄力、有作为的皇帝，在很多方面，甚至比康熙帝还要强上不少，就说大兴改革，整顿吏治等，雍正帝就比康熙帝厉害。
这样的一位皇帝，不是什么臣子能够左右的，年羹尧不行，隆科多也不行。雍正帝可以给他们权力。给他们信任，但当他发现他们有二心，恃功而骄的时候，他也决不手软，正如雍正帝自己所说：
“孰知朕视为一德，彼竟有二心，招权纳贿，擅作威福，欺罔悖负，朕岂能姑息养奸耶？”
所以雍正帝一步步将年羹尧贬职，又将其押解进京，官员们纷纷检举，弄出了九十二条罪状，而年羹尧狱中自裁后的不久，雍正帝对隆科多也出手了。
其实，隆科多本人没有太多的罪状等着让雍正帝去抓，但是他的儿子和家仆却仗势欺人，弄出了不少事，而雍正帝就趁机查隆科多，一查自然就查出隆科多问题不少。
不过，最开始雍正帝并没有真的将隆科多下狱，而是贬职，然后让他去处理边疆事务，又让他与沙俄谈判。隆科多以为自己的问题就这样揭过去了，但实际上并没有，雍正帝还在查隆科多，查出他结党营私、私藏玉牒等，一共查出了四十一条罪状，雍正帝将他永远禁锢，仅仅八个月之后就死在了禁所里。
其实我们看隆科多的去世，并非简单的顾命大臣与皇帝的斗争那么简单，还因为佟家，隆科多是佟国维的儿子，当初佟国维和佟家支持的可是八阿哥，虽然隆科多在康熙年间一直中立，没有站队，又在康熙帝临终之际接受顾命，保雍正帝继位。
他是有功，但佟家有过，这如何选择呢？即便雍正帝能够将隆科多与佟家区别开来，那隆科多能否忍心看着佟家被雍正帝打压呢？或许这也是隆科多在雍正帝初即位就知道自己会被皇帝猜忌而死的原因之一吧。