一、媒体的管理混乱不堪
法轮功媒体的管理一直混乱不堪，缺乏起码的凝聚力和团队精神，遇到问题时各执己见，互不配合，内讧频频。
在媒体的正常管理运行上，李洪志清楚地看到他的弟子谁也不愿意被管。他说：“你管我了我就不高兴了，你指挥我了我就不高兴。”（《在大纪元会议上讲法》）他严厉地批评弟子：“当不被采纳或被指出不足时又生出怨恨心，甚至不惜干错事，大有不搅乱事情不解恨的心态，与我要的大法弟子相互配合好、证实法、救度众生背道而驰。”（《警醒》）
出现这些问题，李洪志也无可奈何，只有这样劝自己的弟子：“无论在管理上、经营上……难在哪里呢？就是相互的配合上……可是中国有一句话叫‘一山不藏二虎’，一个王说了算就容易，哇，这么多王在一起，主意就多了，想法就多了，而且都有很强的独断性。这就是大法弟子互相配合上碰到的最大的难度，这种阻碍来自于你们自身。”（《在大纪元会议上讲法》）
这样的劝说显然不能起到任何作用，但问题显然并不仅仅只有这些。
“我又联想到大法弟子办的媒体，大法弟子做什么事时，那肯定耳边会有更多的人发表想法，一大堆建议，这样那样，那样这样，（笑）（众笑）所以参与的人总觉的管理的人有问题，管理的人就觉的参与的人太不配合。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
“管理问题。如果大家都很有才能、很有见解，那么我作为协调人如果管他或者怎么样协调不同的意见，他就说你要向内找。当然修炼回家我可以向内找，但是在这个具体问题上的管理、事情该怎么做，怎么来协调呢？”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
这些问题自然受到弟子的诘问：“新唐人从去年九月份在多伦多落地，到现在大半年过去了，我们的用户量达不到。面临的挑战，我个人在想如何才能突破，管理机构是否对企业负有很重要的责任？”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
弟子的话一针见血，一句话道出了问题的症结，出现这种局面，管理机构应该有不可推卸的责任。在工作中弟子们各执己见，互相指责，谁也不服谁，谁也不让步，造成工作拖沓，难以推进。
二、媒体经营步履维艰
在经营方面，由于法轮功媒体的非主流性，以及它宣传邪教的丑陋行径遭到越来越多人们的厌恶和排斥，使法轮功媒体的经营发展每况愈下，这让李洪志十分忧虑。“新唐人从零八年落地加拿大到现在已经有几个月了。但是在推广订阅的过程中，发现社区对新唐人的认可成度还很有限。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
弟子的这句话看出了问题的实质，为了吸引人眼球，他不得不放下“救度世人”的架子向“常人”靠拢：“要想办好媒体，你们就得立足于这个社会。常人社会的东西不会神来神去的。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
“经营体制的本身是符合常人社会形式的，所以它才能够在常人社会中立足，才能在常人社会中形成。也就是说，人的这种行为符合了这一层的理，那你们也应该尽量的最大限度的符合常人这种形式来办自己的电视台。要想办好，那你们还真得想想办法正规管理，走上良性循环，考虑考虑经营的问题。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
从李洪志的话语里可以看出，虽然法轮功媒体都是为法轮功组织服务的，但“常人社会的东西不会神来神去的”，要想在常人社会里立足，他就必须放下“神”的架子。这对李洪志来说，的确是一个两难的事，看来法轮功媒体只有了两条路可走，一条路是彻底变成“常人媒体”，另一条路就是消失。但目前看来，李洪志选择的是第一条路，可这恰恰是和法轮功背道而驰的，也许当前对李洪志来说，首先考虑对自己的媒体还是“保命”要紧。只是能保多久，那就另当别论了。
三、媒体的人手捉襟见肘
法轮功媒体工作人员大都是李洪志的弟子，他们很多不具备开展媒体工作的技能。
“新唐人成立七、八年了，但许多学员在技能方面没有得到很好的提高，这是学员自己的想法。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
另一方面，法轮功媒体的人手存在着突出问题。“新唐人发展很快，节目也越做越多，但在各地都有人手问题”，“因为做媒体的学员很多人也是身兼数职”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》），“我们很多参与媒体工作的学员都要兼顾常人的工作，那这样很难全力投入媒体的运作。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
人手不足，还要正常工作，就只好米不够水来凑了，于是就有了“忙不过来的时候，有的同修说我们一定要保证数量、一定要多做，有的同修就说，现在这么忙，质量如果做不好还不如少做一点。在迈向更专业化的路上，如何把握的更好？”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）
“神韵演出的完美质量能够真正起到救度众生、震撼人的作用，但大法弟子做东西往往很粗糙，不追求档次，不怎么讲究客观效果。”《在明慧网十周年法会上的讲话》“有一个神韵广告片要翻译成多种语言，剪辑的质量不那么好，我感觉只需半天就可以把它改的完善，但我的一个上司就说，用太长时间了，赶快推出去。”（《在新唐人电视讨论会上的讲话》）这样不负责任工作态度，这样粗制滥造的节目，怎么能够在竞争激烈的媒体市场上立足。
与此同时，由于法轮功媒体盲目发展，人员紧缺，许多语种网站根本无法正常开展。“由于目前翻译人手的限制，法文圆明网和法文明慧网共享翻译文章，所以两个网站的内容非常类似。”（《在明慧网十周年法会上的讲话》）“德语的圆明网因为人手缺乏，想和德文明慧合作，分享资源。”（《在明慧网十周年法会上的讲话》）“顺便再说说英文和其它语种大纪元。我知道现在困难比较多，主要是人手不够，这是最大的难题了。”（《在大纪元会议上讲法》）为了运行，李洪志不得不拆西墙补东墙，四处救火。
四、媒体资金难以为继
资金保障是媒体正常运营的基础。尽管为了法轮功的“白日梦”，弟子们数年来无偿为其服务，但人总要生活吧！随着时间的推移，“圆满”无望，弟子们明显开始动摇。“明慧全职人员的问题。因十来年全职做、没有收入和常人职业，渐渐都去找工作了。”（《在明慧网十周年法会上的讲话》）为了挽留住弟子们，李洪志继续从精神上控制弟子，强调“学法是第一位的”，诱惑弟子继续在遥遥无期的苦修中“精进”。“我不怕大法弟子发大财。你们事做的越大、你们越有钱我才高兴，就怕你们做不到。”（《在大纪元会议上讲法》）“如果你们能够把它在管理上配合好，投入一些大的精力用在这个市场上，把经济效益抓上来，那就能够保证一部份人有工资拿。”（《在大纪元会议上讲法》）但李洪志的美梦实现起来并没有说得那么简单，法轮功媒体都运行数年了，弟子们不还是一点希望都没有看到吗？“渐渐都去找工作了”也许是一个明智的选择，一条道走到黑，最终必定是死路一条。
这些问题和矛盾的存在，让法轮功媒体举步维艰，李洪志更是焦头烂额，这些媒体尽管还在苦苦地支撑，但清心论坛网站关停的下场将是它们的最终结局。